純合子和雜合子的區別是純合子是二倍體中同源染色體上相同位點等位基因相同的基因型個體，雜合子是指二倍體中同源染色體同一位點上的兩個等位基因不相同的基因型個體。純合子不會由于自交而分離出具有不同遺傳因子的個體，因此，育種材料總是純合的，保持其性狀不變。雜合子自交可以得到純合子。顯性純合子是指同源染色體上兩個顯性等位基因型完全相同的個體，全部用大寫字母表示，如AA和AABB。隱形純合子是指同源染色體上兩個隱性等位基因型完全相同的個體，全部用小寫字母表示，如aa和aabb。